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MS入门手册(22):简单界面模型的建立

MS杨站长团队 MS杨站长 2022-11-21

本文为杨站长技术团队制作的《Materials Studio入门手册》第21篇,共约100篇。本教程旨在从零开始带大家入门MS软件,文末可下载更多学习资料。紧跟杨站长,学会计算,拿下顶刊!

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MS入门手册(21):Materials Studio表面建模之分子位置的精确控制

今天我们就要开始为期4~5次(大概,手动滑稽)的关于界面模型建立的教程了,大家一定非常期待吧。

笔者的主项就是做界面研究的,研究方向是异质外延薄膜的制备,在Si衬底上依次生长TiN/MgO/Ir薄膜,为金刚石的异质外延生长提供衬底材料。这个过程涉及到很多次界面模型的建立,我也走过一次次的弯路,现在将一些经验分享给大家,希望大家能够更好的迁移到自己的研究领域。

在这一串薄膜中,大致可以分为两种晶体晶格常数较为接近的,如TiN/MgO、MgO/Ir和Ir/金刚石三组,以及相差较大的Si/TiN一组。

今天我们对前者进行讲解,从而介绍最基本的界面模型搭建方法和注意事项。

首先第一个问题,我们就会涉及到为什么要说到晶体晶格常数。在实际异质外延生长研究中,晶格常数的匹配绝对是一个无法绕过的话题。当沉积物和衬底的晶格常数相差较小时,会形成完全共格或半共格结构,从而降低界面区域的缺陷密度,实现更强的相互作用。可以用下式计算晶格失配度:

其中δ为晶格失配度,aeas分别为外延薄膜和衬底的晶格常数。通常以|δ|作为评价标准,当|δ|<5%时形成完全共格结构,当5%<|δ|<25%形成半共格结构。对于MS建立界面模型,一般认为5%的晶格失配度是可以忽略的,如果比较粗略的情况,可以接受10%的失配度。如果晶格失配度过大,就无法用简单的界面模型进行描述,需要对模型进行一些处理和修改。

下面我们以Ir(100)/金刚石(100)界面为例,介绍一下晶格失配度较低情况下界面模型的搭建步骤。

首先,仍然是导入Ir和金刚石的晶体结构,这个步骤我们之前已经进行过很多次了,相信小伙伴都能够从结构文件夹中找到这两种晶体结构文件。

导入Ir和金刚石的晶体结构

界面结构实际上是两个表面所组成的层,因此接下来我们要根据前面所讲解的表面结构模型的建立方式,分别建立Ir(100)和金刚石(100)的表面结构,实际上在建立表面结构模型之前要对两种晶体先进行几何优化,再用几何优化后的结构建立表面模型,这里我们就省略这个步骤了,小伙伴课后可以自行进行该操作。

在菜单栏中Build->Surfaces->Cleave Surface,切割表面对话框Surface Box选项卡中选择切割平面(100),厚度2.5(直接切割5层),Surface Mesh选项卡中U[0  0.5  -0.5]、V[0  0.5  0.5]向量选择默认值,得到Ir(100)表面。对金刚石晶体进行相似操作得到5层金刚石(100)表面模型。

Ir(100)表面模型

5层金刚石(100)表面模型

接下来我们就可以用这两个表面模型的结构搭建界面模型(Layer)了,在搭建的过程中先要打开这两个表面模型,我们先用菜单栏中的Window->Close All关闭其他窗口,再只打开这两个表面模型。如果模型未打开,在建立层的时候是找不到它们的文件位置的,大概是为了更加方便(稍表怀疑)。

在菜单栏选择Build->Build Layers,打开建立层对话框,在层1中选择衬底的结构文件,层2中选择沉积层的结构文件,可以在后面的名字中填入不同的名字以示区别,选择以表面形式建立层结构。如果建立成晶体,在之后添加真空层将比较困难。

分子筛孔内部的CH4分子

Layer Details选项卡可以将每个表面在其U、V方向进行位移等。Matching选项卡即为选择界面结构的晶格常数,由于两种晶体晶格常数相差比较小,我们可以选择平均值。Options选项卡中有一项,晶格失配度达到5%(可以修改)以上时提示我们。单击Build按钮,没有出现提示,说明晶格失配度在5%以内,可以正常建立界面模型。

Build Layers对话框中的其他选项卡

我们建立的界面模型是一个层状模型,如果想要利用CASTEP模块进行计算,需要建立真空层,使其变为晶体模型。可以按照之前建立真空层的方式进行操作,在c轴方向建立10 Å真空层。

按表面模型方式建立好的模型

添加真空层

于是我们的Ir(100)/金刚石(100)界面模型就建立好了。如果建立Layer的时候按照晶体进行建立,就会发现建立的是Ir/diamond/Ir/diamond…的叠层,中间没有真空层将重复出现的晶体结构分开。Build Layer功能最多支持3层Layer的组合,因此如果要做夹心结构的小伙伴,也可以试一试这个功能,参考我们的教程进行结构模型的建立。好啦,我们今天就到这里,期待下次仍然能够见到您的身影,和我们一起探索MS的奥秘。

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